Françoise Perrot a suivi un double cursus d’histoire/histoire de l’art jusqu’à la licence et participé au recollement des archives de l’Hôtel-Dieu de Beaune pour le diplôme d’études supérieures.
Spécialiste reconnue du vitrail médiéval, elle a fait sa carrière au CNRS (1964-2008), y a été directrice de recherches avec une participation importante au programme international du Corpus Vitrearum Medii Aevi (CVMA)